东都大学附属医院某夜紧急收容了一名头部受创的神秘男子，脑外科值班医生南方仁（大泽隆夫 饰）为其顺利完成手术，手术转醒后男子却莫名出逃。仁在追赶中自台阶摔下昏迷，再次醒来后发现自己已身处一片树林之中，有盘头武士在厮杀。以为在拍时代剧的仁险遭殃及，所幸被青年武士橘恭太郎（小出惠介 饰）所救。仁随负伤的恭太郎回到橘家，在极其简陋的条件下为其进行了手术。目睹手术全过程的恭太郎之妹橘咲（绫濑遥 饰）深受触动...

《仁医2》完结篇延续前篇剧情，历史依旧向着既定方向有条不紊的前行，更多耳熟能详的历史角色悉数登场。南方仁（大泽隆夫 饰）以大夫的身份在江户时代生存了下来，所开设的医馆仁友堂亦步入正轨。一天他得知橘咲（绫濑遥 饰）的母亲患了当时普遍的脚气病，由此决意制作并普及可治愈该病的点心。与此同时，坂本龙马（内野圣阳 饰）出现在仁面前请求帮助。仁随龙马来到京都救治胜海舟的师父佐久间象山，竟从苏醒的后者口中得知了...

繁华大都会中，生活着完全没有名气的小漫画家藤沼悟。日常里他靠在餐馆打工为生，平凡无奇的外表下却隐藏着一个奇特的能力。他总在不经意间进入“再上映”的状态，即当事故即将发生时，短时间下进入时空倒流。只有解决掉事故的关键点，才能让时间顺利流逝。在遭遇车祸后，家住北海道的妈妈来到悟的公寓，谁知不久妈妈却被人入室杀害。悟在躲避警察追捕中进入“再上映”，谁知竟然回到了1988年的小学时代。当时同镇名叫雏月加代...

这次原创故事的时间线定在前作结局后的一年，因此在前作中因病去世的亚希子丈夫、竹野内丰饰演的宫本良一也将再次出现。亚希子再就业的一年后，时间是2019年的秋天，亚希子在大阪，美雪在东京，两人分居两地。亚希子在大型咨询公司中依然精明强干，表现出色，丝毫看不出有10年的空窗期。而成为大学生的美雪仍旧是惹人喜爱、我行我素。她的每天都在社团或是打工中度过，十分充实。另外，美雪和发小大树(井之胁海)的关系依旧...

宝石店店长被杀事件谜团重重，由于新发现，sir厅决定再次搜查。sir厅搜查一科特搜一组的“堀田小组”负责本次搜查，他们顺利抓到了嫌疑犯，嫌疑犯也主动承认了犯罪行为。但奇怪的是，堀田小组被莫名解散，津原等人都被调到了其他部门.........

外科医生冲田一光（木村拓哉 饰）结束了在海外为期十年的学习和实验，满载着经验与热情回到了自己曾经工作过的坛上纪念医院，尽管曾经在这里有过一段并不愉快的回忆，但和离开时的自己相比，如今的冲田一光更加自信和强大。 　　儿科医生深冬（竹内结子 饰）是院长的女儿，亦是冲田一光曾经的恋人，只是，如今她已经成为了脑外科医生壮大（浅野忠信 饰）的妻子。壮大为了自己在医院的前途和发展做了院长家的入赘女婿，并最终...