星元122年―― 　　这是众多企业扩展至宇宙，并构筑了巨大经济圈的时代。 　　从水星转学到阿斯提卡西亚高等专门学园的斯莱塔·墨丘利，作为米奥莉奈·伦布兰的新郎和高达公司的一员，过着充满邂逅和刺激的学园生活。 　　奎达工厂事件两周后，斯莱塔在学园里边满心期待着和米奥莉奈的再会边度日。 　　与此同时，米奥莉奈在贝纳里特集团本部照看着父亲。 　　向二人袭来的新的困难与迫近的决断。 　　少女们...

沐浴后能致死的剧毒之雨“Blue Cyst”所导致的大灾难“新月之泪”。在那之后经过100多年的时间，人类终于开始走上了克服这一灾难的道路。在荒废世界的村落“Nest”中坚强生活的人们身边，发现了搭载类双对思考型AI的类人“梅加斯”的身影。 　　时间是公元2242年，失去记忆而沉睡的梅加斯，迎来了觉醒的时刻一-...