国立爱丽丝研究机关学园本部不同于一般的学园，只招收具备特殊能力的学生，这种能力被称之为“爱丽丝”。因为好友今井萤（钉宫理惠 配音）转学从乡间来到了城里的爱丽丝学园，无论如何也不想和萤分开的佐仓蜜柑（植村加奈 配音）因此离家出走，跟随萤来到了学园。但没有超能力的她根本无法进入，被学院老师鸣海先生（石田彰 配音）救助后，意外地开发了蜜柑的超能力，于是，机缘巧合下，蜜柑也进入了爱丽丝学园，达成了她和萤在...

奇力男谢洛（森久保祥太郎 配音）自幼失去了双亲，沦为孤儿，在孤儿院过着孤苦伶仃的生活。期间，他结识了名为阿丽莎（筱原惠美 配音）的女孩，两人相依为命，共同来到牙之塔学习黑魔法。实际上，奇力男谢洛一直默默的爱慕着阿丽莎，可是，在阿丽莎的眼中，奇力男谢洛仅仅是一个需要她照顾的弟弟一般的存在。　　阿丽莎喜欢的，是她的老师查尔德曼（中田让治 配音），然而，查尔德曼却拒绝了阿丽莎的表白。伤心之中，阿丽莎开始...

距圣诞节仅有8天时间，SOS团在凉宫春日的号召下，不出意料地策划了一场圣诞狂欢派对。但就在12月18日这天早晨，阿虚却发现周围的世界有了些许变化。1年9班消失不见，朝比奈学姐视其形同路人，甚至早已死去的朝仓也代替凉宫春日坐在了阿虚的后面，而春日则如同人间蒸发一般无人知晓。当他冲向SOS团的教室时，只看到了孤零零坐在角落里看书的长门有希，一向淡定自若、冷如冰霜的长门大神也变成了怯懦害羞的乖乖女。从前...

在偏僻的小村庄——雏见泽村过着愉快生活的少年前原圭一，得知了在这和平村庄中发生的分尸杀人案件。而此事件，又与被称为「御社神的作祟」的一连串离奇死亡案件有所关联。...

...